Una larga lista de aves coloridas incluyen a especies de papagayos y tucanes que se los encuentra en la selva ecuatoriana. Aves más grandes como el hoacín, el gallito de la roca, el guacamayo rojo y el águila harpía son algunas de las más representativas de la Amazonía ecuatoriana. Cerca de 400 especies de reptiles y de anfibios se los encuentra en la Amazonía de Ecuador, esto incluye a cientos de diversas ranas venenosas de cuyos venenos los nativos elaboran el curare, un veneno paralizante con el cual cazan toda clase de presas dentro de la selva amazónica, así como enormes Anacondas de más de 7 metros.
También hay gran cantidad de insectos, que constituye el 90% de la fauna en la Amazonía.
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