En todo el territorio nacional surgió un sentimiento de oposición al militarismo extranjero, personificado en Juan José Flores. En 1.833, en Quito se fundó la sociedad antifloreanista llamada “El Quiteño Libre”, siendo su personaje más destacado, Pedro Moncayo, quien redactaba un semanario que atacaba sistemáticamente a Juan José Flores.
Paralelamente, Vicente Rocafuerte, en calidad de diputado por Guayas, atacaba fuertemente al gobierno, por lo que fue conminado al destierro, ante lo cual se atrincheró en Guayaquil, recibiendo el respaldo popular.
Flores organizó sus tropas y avanzó sobre Guayaquil, por lo que Rocafuerte se refugió en la Isla Puná. Finalmente, en 1.834, Flores apresó a Rocafuerte, mientras que en Quito, José Félix de Valdivieso se sublevaba reclamando el poder.
Flores y Rocafuerte acordaron alternarse en el poder, por ello Rocafuerte se convirtió en Jefe Supremo. Flores, por su parte, derrotó a las fuerzas de José Félix de Valdivieso en la Batalla de Miñarica (Sur de Ambato).
Rocafuerte, convertido en Jefe Supremo, convocó a una Asamblea Constituyente, la misma que redactó la Segunda Constitución y nombró a Vicente Rocafuerte, como Presidente de la República y a José Joaquín de Olmedo, como Vicepresidente.
